作为国家指定接收埃博拉患者的医疗机构之一，22日，位于东京都墨田区的都立墨东医院举行了相关训练，内容包括患者住院时的人员配置和分工等。日本国立医疗研究中心医师加藤康幸为医院约200名工作人员现场指导说明。加藤表示，埃博拉病毒即便是很少的量也同样存在感染风险。含有病毒的呕吐物、血液等挥发成雾状时，在其中的人或许还没有意识到自己已被感染。
日本厚生劳动省从10月开始，决定正式在各指定医疗机构开展相关训练，训练更加关注二次感染预防，包括参与治疗的医师和护士工作服的穿脱等细节。
同时，日本厚生劳动省还进一步加强了边境检疫工作。来自主要疫情国的游客必须在机场或港口向检疫部门报告，如出现症状将立即被送往上述指定医疗机构。以在主要疫情国与患者有过直接接触的人为对象，必须在病毒最长潜伏期（21天）内每天早晚各1次向检疫所报告体温等健康状况。
目前，日本应对埃博拉疫情仍然存在课题。接收埃博拉患者对医院换气、排水、给水硬件条件要求较高，青森、宫城、秋田等9个地方自治体目前没有指定接收医疗机构。
